54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0815 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  100 
 
 
1074 aa  2239    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  47.74 
 
 
1066 aa  989    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  40.39 
 
 
1067 aa  801    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  42.88 
 
 
1091 aa  870    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  46.05 
 
 
1074 aa  937    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  36.31 
 
 
1063 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  43.25 
 
 
1068 aa  863    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  49.2 
 
 
1182 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  53.49 
 
 
772 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  52.94 
 
 
776 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  47.78 
 
 
765 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  45.91 
 
 
1046 aa  355  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  46.43 
 
 
1171 aa  323  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  45.27 
 
 
1013 aa  310  6.999999999999999e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  39.39 
 
 
924 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  40.16 
 
 
922 aa  285  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  39.42 
 
 
911 aa  281  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  42.82 
 
 
917 aa  277  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  41.87 
 
 
888 aa  276  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 
963 aa  229  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  32.52 
 
 
1097 aa  216  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  34.44 
 
 
922 aa  211  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  44.49 
 
 
792 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  31 
 
 
984 aa  198  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  31.22 
 
 
805 aa  196  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  30.29 
 
 
883 aa  192  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  32.68 
 
 
1129 aa  189  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  42.02 
 
 
782 aa  181  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  30.77 
 
 
785 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.06 
 
 
841 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  28.25 
 
 
768 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  26.83 
 
 
725 aa  90.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
833 aa  88.6  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  26.54 
 
 
759 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  26.6 
 
 
1737 aa  81.6  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  24.14 
 
 
893 aa  76.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  28.34 
 
 
1178 aa  75.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  25.88 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  20.5 
 
 
998 aa  71.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.07 
 
 
626 aa  69.7  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  36.73 
 
 
646 aa  61.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 
562 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  30.09 
 
 
468 aa  54.7  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0642  LamG domain-containing protein  26.34 
 
 
247 aa  51.6  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  29.61 
 
 
756 aa  51.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.63 
 
 
507 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  48.5  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  29.84 
 
 
646 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  26.24 
 
 
724 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  35.19 
 
 
136 aa  47.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  32.43 
 
 
503 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  30.09 
 
 
729 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  31.63 
 
 
651 aa  45.8  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  31.62 
 
 
131 aa  45.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>