59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1120 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
841 aa  1744    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  45.81 
 
 
785 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  43.77 
 
 
768 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  29.95 
 
 
1178 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  32.26 
 
 
833 aa  165  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  31.12 
 
 
759 aa  159  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  30.63 
 
 
1737 aa  150  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  27.47 
 
 
772 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  26.92 
 
 
805 aa  127  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  28.53 
 
 
1046 aa  127  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  30.52 
 
 
1068 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  26.55 
 
 
911 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  28.87 
 
 
1129 aa  122  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  28.16 
 
 
1013 aa  122  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  28.09 
 
 
922 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  28.25 
 
 
924 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  26.38 
 
 
883 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  27.95 
 
 
984 aa  118  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  26.02 
 
 
765 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  29.11 
 
 
1097 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  26.9 
 
 
917 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  27.41 
 
 
1091 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  30 
 
 
562 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  27.32 
 
 
1063 aa  111  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  27.4 
 
 
922 aa  111  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  24.39 
 
 
963 aa  111  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.28 
 
 
626 aa  111  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  27.06 
 
 
1074 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  27.64 
 
 
1074 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  30.11 
 
 
565 aa  108  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  27.78 
 
 
1171 aa  108  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  24.24 
 
 
893 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  27.51 
 
 
1066 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  30.1 
 
 
725 aa  94.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  26.24 
 
 
1067 aa  94  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  26.22 
 
 
1182 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  40.83 
 
 
147 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  28.63 
 
 
792 aa  93.2  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  26.84 
 
 
776 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  26.41 
 
 
782 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  28.85 
 
 
998 aa  72.4  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  34.29 
 
 
132 aa  66.6  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  36.08 
 
 
724 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  33.03 
 
 
503 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  33.66 
 
 
651 aa  62.4  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  33.33 
 
 
646 aa  62.4  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  30.72 
 
 
465 aa  62  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  23.78 
 
 
756 aa  61.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  38.38 
 
 
507 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  35.79 
 
 
729 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  25.22 
 
 
888 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  34.21 
 
 
716 aa  58.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  34.04 
 
 
468 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  32.38 
 
 
132 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  31.82 
 
 
124 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  32.33 
 
 
137 aa  52  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  34.52 
 
 
299 aa  49.3  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  28.85 
 
 
129 aa  48.9  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>