56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1593 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  100 
 
 
716 aa  1449    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  39.61 
 
 
724 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  39.06 
 
 
729 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  31.36 
 
 
468 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32.49 
 
 
507 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  29.2 
 
 
503 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  27.78 
 
 
465 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  32.38 
 
 
768 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  30.68 
 
 
785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.88 
 
 
779 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  28.51 
 
 
976 aa  78.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1712  hypothetical protein  27.83 
 
 
807 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0116958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1444  hypothetical protein  27.83 
 
 
807 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.239906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 
775 aa  74.7  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.71 
 
 
762 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.51 
 
 
772 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  31.62 
 
 
756 aa  61.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  33.02 
 
 
1097 aa  60.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.7 
 
 
1129 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.91 
 
 
774 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  37.11 
 
 
917 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  34.21 
 
 
841 aa  58.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  36.52 
 
 
219 aa  55.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 
652 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  28.97 
 
 
984 aa  54.3  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  33.68 
 
 
922 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  30.89 
 
 
1182 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  24.34 
 
 
795 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  28.43 
 
 
1013 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  37 
 
 
474 aa  51.6  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  27.66 
 
 
646 aa  50.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  25.2 
 
 
1063 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  35.11 
 
 
805 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  29.63 
 
 
883 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  29.57 
 
 
924 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  46 
 
 
621 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  26.27 
 
 
776 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  30 
 
 
911 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  23.68 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  23.49 
 
 
1091 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  26.02 
 
 
1046 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  23.71 
 
 
651 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  30.11 
 
 
922 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  31.03 
 
 
299 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  26.17 
 
 
1737 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.67 
 
 
344 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  34.12 
 
 
848 aa  45.8  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  25.97 
 
 
397 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  25.97 
 
 
397 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  24.79 
 
 
772 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  24.55 
 
 
132 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  24.02 
 
 
1074 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  27.78 
 
 
143 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
551 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2325  protein of unknown function DUF989  26.75 
 
 
397 aa  44.3  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.547716  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  26.45 
 
 
397 aa  44.3  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>