42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2090 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
1178 aa  2420    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  30.79 
 
 
759 aa  167  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  29.95 
 
 
841 aa  166  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.43 
 
 
1737 aa  151  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  28.61 
 
 
833 aa  145  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  25.66 
 
 
626 aa  144  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  23.99 
 
 
785 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  25.66 
 
 
998 aa  124  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  24.44 
 
 
765 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  24.68 
 
 
893 aa  121  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  25.07 
 
 
768 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  27.01 
 
 
565 aa  114  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  31.63 
 
 
725 aa  113  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  27.22 
 
 
562 aa  109  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  21.92 
 
 
772 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  21.21 
 
 
776 aa  95.9  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  31.75 
 
 
792 aa  87  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  31.2 
 
 
805 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  38.99 
 
 
1097 aa  83.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  26.29 
 
 
1068 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  26.5 
 
 
984 aa  80.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
963 aa  79.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  29.63 
 
 
922 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  28.34 
 
 
1074 aa  75.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  28.52 
 
 
782 aa  74.3  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  27.32 
 
 
883 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  25.37 
 
 
1063 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  28.72 
 
 
1129 aa  69.3  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  21.63 
 
 
1091 aa  69.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  23.26 
 
 
1074 aa  68.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  22.17 
 
 
1171 aa  67.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  26.79 
 
 
1067 aa  67.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  29.78 
 
 
1046 aa  65.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
1066 aa  65.1  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  25.41 
 
 
888 aa  63.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  26.18 
 
 
1182 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  22.32 
 
 
911 aa  62.4  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
917 aa  62  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  22.07 
 
 
1013 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  23.05 
 
 
922 aa  60.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  22.54 
 
 
924 aa  59.3  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  36.47 
 
 
4433 aa  45.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>