41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1727 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
565 aa  1167    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.64 
 
 
626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  28.69 
 
 
1737 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  26.26 
 
 
893 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  23.02 
 
 
785 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  27.35 
 
 
759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
768 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  27.01 
 
 
1178 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  21.98 
 
 
833 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
765 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  30.11 
 
 
841 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  30.5 
 
 
725 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  25.26 
 
 
776 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  23.47 
 
 
998 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  29.22 
 
 
883 aa  94.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  24.11 
 
 
772 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  23.28 
 
 
562 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  28.85 
 
 
792 aa  85.5  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  28.93 
 
 
1129 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  30.41 
 
 
1171 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  26.94 
 
 
782 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  54.55 
 
 
1067 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  26.99 
 
 
1046 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  28.08 
 
 
1066 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  27.09 
 
 
1068 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
1091 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
805 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  25.88 
 
 
1074 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  28.64 
 
 
1063 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  27.09 
 
 
984 aa  71.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  24.77 
 
 
963 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  23.22 
 
 
917 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  33.57 
 
 
922 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  25.48 
 
 
1182 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  24.76 
 
 
924 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  26.34 
 
 
1074 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  38.82 
 
 
888 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  23.88 
 
 
922 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  30.86 
 
 
1097 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  25.25 
 
 
1013 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  21.78 
 
 
911 aa  53.9  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>