57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3921 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
1097 aa  2259    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  41.38 
 
 
1129 aa  307  7e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  42.37 
 
 
922 aa  300  9e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  40.43 
 
 
984 aa  292  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  41.57 
 
 
963 aa  286  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  41.27 
 
 
883 aa  282  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  40.79 
 
 
1068 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  37.16 
 
 
1182 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  36.49 
 
 
805 aa  239  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  38.48 
 
 
1046 aa  229  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  35.59 
 
 
1066 aa  227  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  36.04 
 
 
1063 aa  222  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  36.69 
 
 
772 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  32.52 
 
 
1074 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  32.04 
 
 
1013 aa  214  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  34.82 
 
 
765 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  36.41 
 
 
776 aa  210  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  34.26 
 
 
1074 aa  206  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  34.26 
 
 
1091 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  33.59 
 
 
924 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  33.07 
 
 
911 aa  198  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  31.71 
 
 
922 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  31.99 
 
 
917 aa  194  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  33.24 
 
 
1067 aa  189  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  38.62 
 
 
792 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  38.49 
 
 
782 aa  179  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  34.99 
 
 
888 aa  172  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  34.21 
 
 
1171 aa  171  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  27.76 
 
 
785 aa  140  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  28.3 
 
 
768 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  29.11 
 
 
841 aa  117  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  40 
 
 
147 aa  90.1  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.54 
 
 
1737 aa  86.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  38.99 
 
 
1178 aa  83.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  36.71 
 
 
998 aa  82.4  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.32 
 
 
626 aa  75.1  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  26.89 
 
 
833 aa  74.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  28.52 
 
 
893 aa  72.8  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  25.12 
 
 
759 aa  71.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  31.55 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  22.51 
 
 
725 aa  67.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  36.89 
 
 
503 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  38.46 
 
 
507 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  39.09 
 
 
468 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  34.19 
 
 
724 aa  64.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  35.85 
 
 
646 aa  63.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  38.3 
 
 
729 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  30.86 
 
 
565 aa  62  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  28.14 
 
 
562 aa  61.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  33.02 
 
 
716 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  31.37 
 
 
756 aa  54.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  32.35 
 
 
132 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3401  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.97 
 
 
851 aa  52.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  51.6  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  32.95 
 
 
651 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  30.43 
 
 
129 aa  44.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  27.13 
 
 
124 aa  44.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>