56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0775 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
883 aa  1826    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  36.21 
 
 
1129 aa  489  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  34.98 
 
 
805 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  33.67 
 
 
922 aa  409  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  39.05 
 
 
792 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  34.38 
 
 
782 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  41.27 
 
 
1097 aa  293  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  35.27 
 
 
984 aa  279  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  33.72 
 
 
1013 aa  243  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  38.3 
 
 
1068 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  38.19 
 
 
1046 aa  235  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 
963 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  37.4 
 
 
924 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  36.19 
 
 
922 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  35.41 
 
 
1066 aa  214  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  32.29 
 
 
1182 aa  214  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 
917 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  32.71 
 
 
1063 aa  212  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  34.78 
 
 
765 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  34.78 
 
 
1171 aa  207  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  33.89 
 
 
911 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  30.75 
 
 
1091 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  35.03 
 
 
1074 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 
776 aa  201  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 
772 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  31.21 
 
 
1067 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  30.29 
 
 
1074 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  31.82 
 
 
888 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  26.77 
 
 
841 aa  129  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  26.18 
 
 
785 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  25.67 
 
 
768 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  22.08 
 
 
725 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  28.78 
 
 
759 aa  95.1  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  29.22 
 
 
565 aa  94.7  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  27.62 
 
 
833 aa  88.6  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  25.6 
 
 
1737 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  37.74 
 
 
147 aa  75.1  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  27.32 
 
 
1178 aa  74.3  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  32.41 
 
 
998 aa  71.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.34 
 
 
626 aa  70.5  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  40.82 
 
 
465 aa  62.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  36.36 
 
 
893 aa  61.6  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  33.33 
 
 
503 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  25.82 
 
 
562 aa  59.7  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  35.56 
 
 
729 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  34.74 
 
 
507 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  34.41 
 
 
724 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  26.45 
 
 
646 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  28.66 
 
 
716 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  34.41 
 
 
468 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  34.35 
 
 
651 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15635  predicted protein  29.46 
 
 
1124 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.173921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 
756 aa  45.8  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  30.43 
 
 
129 aa  45.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  32.95 
 
 
124 aa  45.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>