63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5453 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
924 aa  1914    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  56.83 
 
 
917 aa  1078    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  48.69 
 
 
911 aa  881    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  58.98 
 
 
922 aa  1114    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  47.42 
 
 
1171 aa  352  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  48.96 
 
 
1046 aa  330  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  46.63 
 
 
1066 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  44.47 
 
 
1074 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  47.55 
 
 
1068 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  29.52 
 
 
883 aa  310  6.999999999999999e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  42.79 
 
 
1182 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  44.73 
 
 
776 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  43.34 
 
 
1013 aa  303  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  43.63 
 
 
772 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  41.88 
 
 
1063 aa  298  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  39.39 
 
 
1074 aa  295  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  41.51 
 
 
1091 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  41.64 
 
 
765 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  43.59 
 
 
1067 aa  282  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  36.25 
 
 
888 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  32.1 
 
 
922 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  35.28 
 
 
963 aa  209  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  45.08 
 
 
792 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  34.68 
 
 
1129 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  33.59 
 
 
1097 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  44.72 
 
 
782 aa  198  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  32.44 
 
 
984 aa  185  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  32 
 
 
805 aa  185  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  28.25 
 
 
841 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  26.76 
 
 
768 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  26.86 
 
 
785 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  30 
 
 
1737 aa  94  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  25.26 
 
 
626 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  26.57 
 
 
759 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  26.67 
 
 
833 aa  90.1  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  25.98 
 
 
725 aa  82  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  26.32 
 
 
998 aa  71.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  25.12 
 
 
893 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  24.76 
 
 
565 aa  66.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  34.65 
 
 
468 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  35.71 
 
 
503 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  22.54 
 
 
1178 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  30.77 
 
 
147 aa  58.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  29.29 
 
 
646 aa  57.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  29.57 
 
 
124 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  28.3 
 
 
131 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  30.21 
 
 
756 aa  51.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  25.69 
 
 
136 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  32.41 
 
 
394 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  32.41 
 
 
394 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  29.57 
 
 
716 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  32.41 
 
 
394 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  30.53 
 
 
251 aa  48.1  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  30.91 
 
 
390 aa  48.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  33.71 
 
 
299 aa  48.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  26.45 
 
 
132 aa  48.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  24.62 
 
 
132 aa  48.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  30.1 
 
 
729 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  30.28 
 
 
724 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  32.26 
 
 
465 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  31.18 
 
 
507 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  24.87 
 
 
562 aa  45.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  27.12 
 
 
393 aa  44.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>