51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0465 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  65.89 
 
 		 132 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  58.59 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  63.72 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  36.11 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  36.84 
 
 		 646 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  35.71 
 
 		 503 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.63 
 
 		 756 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  33.6 
 
 		 1046 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36.36 
 
 		 507 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  33.03 
 
 		 1091 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 1063 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  32.14 
 
 		 1737 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  34.65 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  30.53 
 
 		 922 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  35.92 
 
 		 963 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 768 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  26.15 
 
 		 911 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  29.27 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  34.95 
 
 		 1129 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  28.7 
 
 		 724 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  36 
 
 		 465 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  35.29 
 
 		 1097 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  29.63 
 
 		 776 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  25.81 
 
 		 924 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  32 
 
 		 785 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  27.88 
 
 		 729 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  29.52 
 
 		 917 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  29.46 
 
 		 468 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  34.95 
 
 		 984 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  29.81 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  30.19 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  29.36 
 
 		 765 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1074 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 		 841 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  29.36 
 
 		 1171 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  29.13 
 
 		 805 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  26.85 
 
 		 922 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  28.44 
 
 		 772 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  29.36 
 
 		 1066 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  36.21 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  32.5 
 
 		 758 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 		 651 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  28.7 
 
 		 1182 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  43.75 
 
 		 798 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  30.56 
 
 		 1068 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  30.33 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0046  cytochrome c family protein, putative  24.62 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3446  cis/trans isomerase  38.46 
 
 		 762 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  43.18 
 
 		 784 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>