62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5931 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  100 
 
 		 507 aa  1024    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  53.2 
 
 		 503 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  38.97 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  34.06 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  35.77 
 
 		 724 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  32.26 
 
 		 729 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 716 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  35.69 
 
 		 785 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  36.98 
 
 		 768 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  42.94 
 
 		 219 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  45.65 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  40 
 
 		 963 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  34.62 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  36.84 
 
 		 646 aa  67  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  33.61 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  36 
 
 		 175 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  38.46 
 
 		 1097 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.25 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  41.05 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.62 
 
 		 1655 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  35.35 
 
 		 1129 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  34.29 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  38.38 
 
 		 841 aa  60.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  33.01 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  39.08 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  40.45 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  34.26 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  32.26 
 
 		 1091 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  38 
 
 		 136 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 1737 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  30.63 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  34.65 
 
 		 1182 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  28.79 
 
 		 1046 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  36.26 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  35.35 
 
 		 129 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  54.3  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  31.93 
 
 		 1074 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  35.05 
 
 		 1013 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  30.77 
 
 		 922 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  30.85 
 
 		 756 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  28.81 
 
 		 917 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  32.99 
 
 		 922 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  37 
 
 		 1068 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  34.29 
 
 		 765 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  31.58 
 
 		 805 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 984 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2220  heat shock protein DnaJ domain protein  32.61 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2007  heat shock protein DnaJ domain protein  32.61 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8484999999999997e-22 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 883 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1074 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  32.58 
 
 		 911 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  33.33 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  34.78 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  28.72 
 
 		 651 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  30.69 
 
 		 1063 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  44.58 
 
 		 1085 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  29.84 
 
 		 1171 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  31.18 
 
 		 924 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 1066 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  44.3  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  33.67 
 
 		 421 aa  43.5  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>