62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1801 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  100 
 
 		 522 aa  1012    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  46.54 
 
 		 661 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  50.42 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  50.82 
 
 		 401 aa  299  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  45.79 
 
 		 518 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  39.92 
 
 		 620 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  43.28 
 
 		 981 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  34.83 
 
 		 647 aa  210  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  35.45 
 
 		 516 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  29.13 
 
 		 781 aa  127  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  38.33 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  31.28 
 
 		 815 aa  121  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  37.43 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  30.74 
 
 		 770 aa  114  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  29.58 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  30.37 
 
 		 614 aa  107  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30 
 
 		 344 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  29.36 
 
 		 692 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  31.92 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  29.62 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  29.21 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.77 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  28.69 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  31.56 
 
 		 897 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  27.95 
 
 		 916 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  38.6 
 
 		 254 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  31.45 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  31.93 
 
 		 553 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  30.93 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  33.18 
 
 		 241 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.79 
 
 		 1107 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  26.69 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  27.8 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.17 
 
 		 1266 aa  57  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  20.67 
 
 		 1655 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1628  hypothetical protein  35.04 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.05 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  26.4 
 
 		 374 aa  53.9  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88061  predicted protein  27.2 
 
 		 936 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0276819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  29.18 
 
 		 643 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  25.91 
 
 		 816 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.33 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  25.16 
 
 		 591 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  22.27 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.69 
 
 		 760 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  28.24 
 
 		 766 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  30.19 
 
 		 262 aa  47  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  30.19 
 
 		 262 aa  47  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  26.25 
 
 		 772 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  31.68 
 
 		 175 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  27.71 
 
 		 1012 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  23.27 
 
 		 476 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  27.45 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  25.9 
 
 		 1882 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  35.24 
 
 		 807 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  26.29 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  23.67 
 
 		 1112 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  25.65 
 
 		 1070 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00110  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 		 1608 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  25.65 
 
 		 1070 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1389 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  26.89 
 
 		 450 aa  43.5  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>