59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1199 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  100 
 
 		 486 aa  968    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.34 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32.24 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  29.92 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  28.98 
 
 		 620 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  28.06 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  28.99 
 
 		 661 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  29.11 
 
 		 981 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  29.43 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  31.63 
 
 		 1085 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  29.8 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.61 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  27.02 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.5 
 
 		 1655 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  26.52 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  25.43 
 
 		 401 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1052 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  27.68 
 
 		 295 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  28.92 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  28.92 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10516  SCF E3 ubiquitin ligase complex F-box protein grrA (SCF substrate adapter protein grrA)(F-box and leucine-rich repeat protein grrA)(F-box/LRR-repeat protein grrA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q15I80]  27.82 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000155754  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  39.18 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  31.13 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  31.01 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  22.5 
 
 		 781 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83849  protein required for glucose repression and for glucose and cation transport  26.13 
 
 		 725 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  31.58 
 
 		 923 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.99 
 
 		 995 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  26.84 
 
 		 1088 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.23 
 
 		 531 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  25.49 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.17 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  26.74 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.62 
 
 		 1107 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  34.67 
 
 		 341 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  28.28 
 
 		 765 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  23.08 
 
 		 718 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  28.28 
 
 		 779 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1351 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  29.56 
 
 		 766 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.07 
 
 		 542 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  26.35 
 
 		 993 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  29.56 
 
 		 766 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.71 
 
 		 1011 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.07 
 
 		 772 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  28.68 
 
 		 760 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  28.93 
 
 		 755 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  35.21 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  31.25 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  32.18 
 
 		 789 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  32.18 
 
 		 789 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  26.16 
 
 		 994 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  26.44 
 
 		 954 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  26.62 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1814  hypothetical protein  32.46 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115663  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  28.24 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  26.6 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  27.32 
 
 		 692 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04270  DNA dependent ATPase, putative  31.3 
 
 		 600 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>