20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2988 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  914    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  65.87 
 
 		 452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  38.46 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.25 
 
 		 481 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  37.19 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2220  heat shock protein DnaJ domain protein  35.46 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2007  heat shock protein DnaJ domain protein  35.31 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8484999999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.12 
 
 		 248 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 962 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  40.45 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  34.83 
 
 		 219 aa  53.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  35.44 
 
 		 344 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0822  heat shock protein DnaJ-like protein  33.61 
 
 		 635 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.77208  normal  0.437006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4125  heat shock protein DnaJ domain protein  23.43 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00694826  hitchhiker  0.0000294861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  33.77 
 
 		 175 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  32.39 
 
 		 149 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1223  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0440  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0372  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  37.7 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>