23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6624 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  340  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  40.37 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36.72 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.74 
 
 		 1655 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  31.01 
 
 		 486 aa  57.4  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  27.35 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  38.46 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.65 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  30 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  36.63 
 
 		 401 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  30.63 
 
 		 981 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  28 
 
 		 724 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  35.58 
 
 		 1085 aa  47.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.44 
 
 		 481 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  31.68 
 
 		 522 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  28.89 
 
 		 620 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  35.9 
 
 		 452 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  33.77 
 
 		 456 aa  44.7  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  28.28 
 
 		 729 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  28.22 
 
 		 531 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  30.47 
 
 		 661 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  37.76 
 
 		 516 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>