53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01777 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01777  GALA protein  100 
 
 		 981 aa  1919    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  44.65 
 
 		 620 aa  364  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  39.5 
 
 		 647 aa  298  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  43.19 
 
 		 522 aa  284  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  38.15 
 
 		 661 aa  261  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  41.29 
 
 		 464 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  34.45 
 
 		 518 aa  170  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  37.74 
 
 		 401 aa  168  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  26.81 
 
 		 781 aa  111  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  28.15 
 
 		 614 aa  99.8  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  34.34 
 
 		 295 aa  97.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.89 
 
 		 344 aa  94.7  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  29.56 
 
 		 471 aa  92.8  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  26.97 
 
 		 815 aa  89  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  31.76 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  37.23 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.73 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.88 
 
 		 486 aa  77.4  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  30.42 
 
 		 466 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.88 
 
 		 1107 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  27.82 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  29.97 
 
 		 916 aa  68.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  27.52 
 
 		 692 aa  67.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  30.52 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.25 
 
 		 1655 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  28.27 
 
 		 897 aa  59.7  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  29.51 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  31.58 
 
 		 447 aa  55.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  26.12 
 
 		 372 aa  54.3  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  31.67 
 
 		 175 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  26.52 
 
 		 553 aa  52.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  28.48 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1628  hypothetical protein  25.26 
 
 		 481 aa  50.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1085 aa  50.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.24 
 
 		 1344 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  26.22 
 
 		 553 aa  50.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2323  hypothetical protein  30.65 
 
 		 354 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  26.91 
 
 		 591 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00409  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04960)  37.5 
 
 		 807 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000909963  normal  0.437099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  26.44 
 
 		 510 aa  48.1  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  37.19 
 
 		 465 aa  48.1  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  33.91 
 
 		 262 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  33.91 
 
 		 262 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.01 
 
 		 1679 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89214  predicted protein  28.3 
 
 		 445 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.74 
 
 		 1041 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  22.74 
 
 		 1070 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  22.74 
 
 		 1070 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  34.13 
 
 		 1266 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4101  hypothetical protein  32.77 
 
 		 341 aa  45.8  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  24.25 
 
 		 640 aa  44.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  31.78 
 
 		 807 aa  44.7  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  25.12 
 
 		 863 aa  44.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>