21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0489 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  899    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  64.15 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  40.53 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.59 
 
 		 481 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  38.02 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2220  heat shock protein DnaJ domain protein  35.92 
 
 		 441 aa  226  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2007  heat shock protein DnaJ domain protein  35.15 
 
 		 441 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8484999999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.04 
 
 		 248 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 962 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36.26 
 
 		 507 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  35.16 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  37.04 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0098  hypothetical protein  26.87 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  37.29 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  33.67 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  35.9 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  37.61 
 
 		 1085 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.83 
 
 		 1655 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  37.04 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4125  heat shock protein DnaJ domain protein  25.86 
 
 		 247 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00694826  hitchhiker  0.0000294861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0822  heat shock protein DnaJ-like protein  28.87 
 
 		 635 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.77208  normal  0.437006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>