63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3699 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1018    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  53 
 
 
507 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  39.33 
 
 
468 aa  319  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  32.3 
 
 
465 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  29.32 
 
 
729 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  29.96 
 
 
724 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  29.58 
 
 
716 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  33.82 
 
 
785 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  32.58 
 
 
768 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  36.05 
 
 
219 aa  93.6  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  34.65 
 
 
1737 aa  81.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  36.28 
 
 
1129 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  39.39 
 
 
805 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  32.69 
 
 
124 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
756 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  36.89 
 
 
1097 aa  67  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  30.77 
 
 
841 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  39.08 
 
 
299 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  37.5 
 
 
651 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  35.51 
 
 
646 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  36.56 
 
 
963 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  35.71 
 
 
136 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  33.96 
 
 
147 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  32.17 
 
 
1046 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  31.39 
 
 
922 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  33.61 
 
 
924 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  32.17 
 
 
132 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  39.58 
 
 
1063 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  27.35 
 
 
175 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  31.13 
 
 
1091 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  34.31 
 
 
1182 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.78 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  37.78 
 
 
922 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  29.41 
 
 
917 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  36.22 
 
 
765 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  29.63 
 
 
776 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  25.86 
 
 
251 aa  53.9  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  34.02 
 
 
984 aa  53.5  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  34.41 
 
 
883 aa  53.5  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32 
 
 
344 aa  53.5  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  31.91 
 
 
1013 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.5 
 
 
1655 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  34.83 
 
 
911 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  36.36 
 
 
1068 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  36.73 
 
 
1074 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  30.33 
 
 
772 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  25.53 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  33.62 
 
 
1066 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  37.97 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4438  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.197621  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  30.2 
 
 
1171 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  32.43 
 
 
1074 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  27.96 
 
 
553 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  29.91 
 
 
553 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  34.02 
 
 
452 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  30.43 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  27.55 
 
 
522 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03480  ubiquitin-protein ligase, putative  31.2 
 
 
928 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.918815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.3 
 
 
481 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  27.36 
 
 
868 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  26.97 
 
 
818 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>