17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1857 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  97.29 
 
 		 553 aa  1058    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  100 
 
 		 553 aa  1120    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  29.97 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  26.56 
 
 		 647 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  27.34 
 
 		 620 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  31.45 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  29.81 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.41 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  24.04 
 
 		 815 aa  50.8  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  28.5 
 
 		 661 aa  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  27.64 
 
 		 344 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  25.27 
 
 		 400 aa  47  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  26.42 
 
 		 981 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.92 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  23.33 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  29.2 
 
 		 503 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>