17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1852 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1120    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  97.29 
 
 
553 aa  1058    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  30.28 
 
 
464 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  26.56 
 
 
647 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  27.34 
 
 
620 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  31.45 
 
 
522 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  30.46 
 
 
401 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.71 
 
 
474 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  24.04 
 
 
815 aa  50.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  28.5 
 
 
661 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  27.64 
 
 
344 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  27.43 
 
 
981 aa  47  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  25.27 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  29.2 
 
 
503 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.92 
 
 
486 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  26.23 
 
 
993 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>