29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1357 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  100 
 
 		 647 aa  1309    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  36.42 
 
 		 620 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  39.5 
 
 		 981 aa  280  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  34.83 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  31.86 
 
 		 661 aa  195  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  36.86 
 
 		 464 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  30.94 
 
 		 518 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  34.65 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  30.72 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.89 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  26.75 
 
 		 815 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  29.15 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  26.06 
 
 		 692 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  29.17 
 
 		 295 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  24.64 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  26.56 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  26.56 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  27.02 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  26.23 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  25.47 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  24.17 
 
 		 781 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  25.29 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  29.17 
 
 		 770 aa  54.3  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  29.05 
 
 		 241 aa  53.9  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  24.64 
 
 		 372 aa  50.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  26.58 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49776  predicted protein  35.51 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  27.53 
 
 		 897 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  30.97 
 
 		 1048 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>