46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42557 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  100 
 
 
692 aa  1382    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  33.4 
 
 
464 aa  150  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  25.68 
 
 
781 aa  127  9e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  34.05 
 
 
770 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  27.01 
 
 
815 aa  107  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  28.96 
 
 
614 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  29.78 
 
 
620 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  28.41 
 
 
466 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  27.19 
 
 
471 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  31.01 
 
 
372 aa  92.8  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  27.88 
 
 
661 aa  89  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  30.24 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  31.15 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  30.7 
 
 
981 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  27.05 
 
 
647 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  29.92 
 
 
510 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  28.27 
 
 
241 aa  79  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  30.94 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  26.95 
 
 
432 aa  73.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  32.44 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  26.42 
 
 
916 aa  68.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  26.7 
 
 
897 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  26.87 
 
 
465 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  26.48 
 
 
591 aa  61.6  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00110  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 
1608 aa  61.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2399  leucine rich repeat protein  30.91 
 
 
368 aa  60.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  28.14 
 
 
295 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  30.85 
 
 
518 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.03 
 
 
344 aa  57.4  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  36 
 
 
254 aa  57  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88061  predicted protein  28.81 
 
 
936 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7574  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.56 
 
 
385 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  30.05 
 
 
476 aa  50.8  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1058  hypothetical protein  34.01 
 
 
746 aa  50.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04862  Ran specific GTPase activating protein An-RanGAP (Eurofung)  24.32 
 
 
417 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.863304  normal  0.748765 
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  25.67 
 
 
404 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  24.12 
 
 
534 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  28.81 
 
 
516 aa  48.5  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1628  hypothetical protein  28.8 
 
 
481 aa  48.1  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34431  predicted protein  28.57 
 
 
261 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362654  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49776  predicted protein  26.36 
 
 
395 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  29.53 
 
 
807 aa  47.4  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  29.53 
 
 
262 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  29.53 
 
 
262 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1753  hypothetical protein  27.78 
 
 
394 aa  44.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0294803 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  27.01 
 
 
1048 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>