42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02003 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02003  GALA protein  100 
 
 		 518 aa  1012    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  45.79 
 
 		 522 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  43.29 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  41.46 
 
 		 661 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  39.03 
 
 		 620 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  46.14 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  35.6 
 
 		 981 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  32.73 
 
 		 647 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  27.63 
 
 		 815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  31.39 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  29.32 
 
 		 471 aa  97.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  29.46 
 
 		 614 aa  94.4  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  24.35 
 
 		 781 aa  92.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  31.28 
 
 		 295 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  32.73 
 
 		 400 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  28.78 
 
 		 770 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  29.01 
 
 		 692 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  29.79 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  25.27 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  26.76 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  33.18 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  27.41 
 
 		 897 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.62 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  26.21 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  26.29 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  23.03 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  36.3 
 
 		 254 aa  57  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  25 
 
 		 916 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.72 
 
 		 1266 aa  53.5  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.81 
 
 		 1107 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  27.7 
 
 		 432 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1754  LRR-repeat protein  32.03 
 
 		 167 aa  50.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.022386 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  27.66 
 
 		 476 aa  50.4  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  28.37 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  28.37 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  30.23 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  30.23 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  27.74 
 
 		 591 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  21.47 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  37.21 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  29.86 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  22.98 
 
 		 618 aa  43.9  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>