188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1864 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  100 
 
 		 1266 aa  2577    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.86 
 
 		 1107 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.19 
 
 		 1041 aa  203  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  40.84 
 
 		 347 aa  155  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.43 
 
 		 1015 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  33.52 
 
 		 531 aa  149  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  39.92 
 
 		 355 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1085 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  31.02 
 
 		 421 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  30.57 
 
 		 772 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  38.82 
 
 		 384 aa  130  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1052 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  31.78 
 
 		 760 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  27.6 
 
 		 718 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  40 
 
 		 341 aa  121  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  38.23 
 
 		 482 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  29.29 
 
 		 760 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  29.41 
 
 		 542 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.54 
 
 		 766 aa  119  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  36.6 
 
 		 354 aa  119  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.12 
 
 		 348 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.03 
 
 		 863 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.12 
 
 		 348 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.62 
 
 		 779 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.62 
 
 		 765 aa  115  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  32.21 
 
 		 995 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  25.55 
 
 		 1112 aa  114  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.62 
 
 		 772 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  30.62 
 
 		 766 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.85 
 
 		 867 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.23 
 
 		 755 aa  114  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  25.98 
 
 		 1070 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  33.88 
 
 		 643 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  25.98 
 
 		 1070 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  36.47 
 
 		 374 aa  112  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  39.14 
 
 		 416 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1351 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  31.47 
 
 		 877 aa  105  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.23 
 
 		 508 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  33.82 
 
 		 789 aa  104  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  33.82 
 
 		 789 aa  104  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.59 
 
 		 1088 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.51 
 
 		 1263 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  25.36 
 
 		 994 aa  101  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  29.44 
 
 		 565 aa  101  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  28.34 
 
 		 892 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  33.48 
 
 		 858 aa  96.3  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.46 
 
 		 954 aa  96.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  29.21 
 
 		 1335 aa  96.3  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  29.46 
 
 		 1012 aa  95.9  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.92 
 
 		 886 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  31.23 
 
 		 631 aa  93.6  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  30.08 
 
 		 993 aa  92.8  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1744 aa  92  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  32.52 
 
 		 571 aa  91.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  28.22 
 
 		 935 aa  90.5  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  32.97 
 
 		 424 aa  90.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  32.61 
 
 		 467 aa  90.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  26.97 
 
 		 1118 aa  89.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.27 
 
 		 452 aa  89.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  30.08 
 
 		 1011 aa  89.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.52 
 
 		 757 aa  87.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  27.72 
 
 		 937 aa  88.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  28.38 
 
 		 528 aa  87.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  27.72 
 
 		 937 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  28.12 
 
 		 998 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  31.15 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  29.61 
 
 		 1780 aa  84.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.57 
 
 		 1749 aa  84.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.14 
 
 		 1024 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  29 
 
 		 399 aa  83.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  33.44 
 
 		 692 aa  83.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.38 
 
 		 1344 aa  82  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  32.64 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  33.16 
 
 		 692 aa  81.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  30.15 
 
 		 400 aa  81.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  26.91 
 
 		 539 aa  80.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  25.66 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  30.93 
 
 		 816 aa  77  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  23.78 
 
 		 925 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  29.06 
 
 		 284 aa  76.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  27.09 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  29.35 
 
 		 498 aa  73.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  34.34 
 
 		 1370 aa  71.6  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  28.5 
 
 		 400 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  25.87 
 
 		 700 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  32.05 
 
 		 788 aa  71.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  32.05 
 
 		 788 aa  71.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2648  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1298 aa  70.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.66 
 
 		 761 aa  70.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  36.81 
 
 		 448 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.8 
 
 		 1679 aa  70.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  32.05 
 
 		 788 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  29.3 
 
 		 765 aa  69.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92844  predicted protein  40 
 
 		 255 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67948  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  34.65 
 
 		 356 aa  67  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  19.17 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  36 
 
 		 290 aa  64.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  32.27 
 
 		 620 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>