55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01686 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  100 
 
 		 661 aa  1301    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  42.64 
 
 		 620 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  46.56 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  47.64 
 
 		 464 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  43.01 
 
 		 981 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  46.12 
 
 		 401 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  41.43 
 
 		 518 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  32.29 
 
 		 647 aa  209  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  29 
 
 		 781 aa  165  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  31.23 
 
 		 815 aa  144  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  31.53 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  32.18 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  33.02 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  34.09 
 
 		 295 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  35.03 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  28.21 
 
 		 770 aa  103  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  27.63 
 
 		 692 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  28.96 
 
 		 372 aa  95.9  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  32.56 
 
 		 466 aa  94.4  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.59 
 
 		 1107 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.1 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  27.7 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.33 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.44 
 
 		 1266 aa  75.5  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  27.23 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  27.07 
 
 		 916 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  32.28 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  30.84 
 
 		 465 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  26.71 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  34.71 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  27.57 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  27.57 
 
 		 553 aa  55.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00110  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 		 1608 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108047  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  35 
 
 		 262 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  35 
 
 		 262 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  31.6 
 
 		 432 aa  54.3  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.11 
 
 		 1655 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  25.05 
 
 		 936 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  28.05 
 
 		 460 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1940  hypothetical protein  25.49 
 
 		 534 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.61 
 
 		 1344 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  23.75 
 
 		 863 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  29.66 
 
 		 476 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  24.82 
 
 		 404 aa  47.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  21.93 
 
 		 618 aa  47.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  25.89 
 
 		 450 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  30.47 
 
 		 175 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  27.09 
 
 		 484 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  35 
 
 		 807 aa  45.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0318  hypothetical protein  29.1 
 
 		 508 aa  45.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  27.31 
 
 		 631 aa  45.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  22.75 
 
 		 1882 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43880  predicted protein  24.56 
 
 		 497 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0654844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  29.23 
 
 		 416 aa  43.9  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>