99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0593 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  100 
 
 		 631 aa  1239    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  57.76 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.03 
 
 		 1679 aa  231  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  27.17 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  43.08 
 
 		 273 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1389 aa  160  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  35.59 
 
 		 452 aa  158  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  37.92 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  34.46 
 
 		 484 aa  137  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  27.31 
 
 		 816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  28.45 
 
 		 384 aa  123  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  37.39 
 
 		 508 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.1 
 
 		 1041 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.09 
 
 		 482 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  28.74 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  41.74 
 
 		 863 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  30.45 
 
 		 386 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  30.35 
 
 		 586 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.23 
 
 		 1266 aa  94.7  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  31.89 
 
 		 479 aa  94  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  35.2 
 
 		 428 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  31 
 
 		 439 aa  92  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  28.46 
 
 		 581 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.55 
 
 		 1263 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.69 
 
 		 1107 aa  85.5  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.21 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.81 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  29.85 
 
 		 450 aa  73.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  29.72 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  35.13 
 
 		 776 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.23 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  30.46 
 
 		 755 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.69 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.69 
 
 		 731 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.9 
 
 		 1749 aa  68.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.69 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  33.61 
 
 		 565 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  30.2 
 
 		 765 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  34.66 
 
 		 788 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.96 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  34.66 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.55 
 
 		 772 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  34.66 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.68 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  33.17 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.6 
 
 		 1015 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1059 aa  63.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  28.76 
 
 		 473 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.95 
 
 		 867 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  29.84 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.7 
 
 		 937 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.63 
 
 		 2132 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  30.69 
 
 		 1780 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  31.85 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.02 
 
 		 937 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  32.48 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.17 
 
 		 972 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  33.49 
 
 		 886 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  30.61 
 
 		 528 aa  54.3  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.99 
 
 		 355 aa  53.9  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2673  hypothetical protein  20.58 
 
 		 293 aa  53.9  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  31.31 
 
 		 400 aa  53.9  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.25 
 
 		 559 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  30.72 
 
 		 2198 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.38 
 
 		 1344 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  31.94 
 
 		 763 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  30.21 
 
 		 435 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1052 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.19 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  29.75 
 
 		 1335 aa  50.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  27.4 
 
 		 384 aa  50.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  27.68 
 
 		 1070 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  24.74 
 
 		 419 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  27.31 
 
 		 1112 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  27.68 
 
 		 1070 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  24.78 
 
 		 765 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.33 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1351 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  27.17 
 
 		 242 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  25.22 
 
 		 418 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  27.88 
 
 		 640 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.76 
 
 		 892 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1578 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  25.22 
 
 		 419 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  29.65 
 
 		 399 aa  47.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  25.22 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  31.3 
 
 		 284 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  25.22 
 
 		 443 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  29.82 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  28.39 
 
 		 772 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30.63 
 
 		 766 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89214  predicted protein  29.26 
 
 		 445 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  25.22 
 
 		 443 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  29.15 
 
 		 301 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  27.35 
 
 		 954 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.32 
 
 		 1088 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  30.84 
 
 		 899 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  27.35 
 
 		 1012 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>