52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1704 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  90.89 
 
 		 419 aa  744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  847    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  92.88 
 
 		 443 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  92.88 
 
 		 431 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  92.59 
 
 		 443 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  92.89 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  92.89 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01428  hypothetical protein  92.79 
 
 		 111 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01440  hypothetical protein  92.79 
 
 		 111 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.67 
 
 		 1041 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  29.06 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  26.61 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  28.77 
 
 		 816 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  27 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1744 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33 
 
 		 1015 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.73 
 
 		 1263 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  27.06 
 
 		 586 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  23.55 
 
 		 731 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  24.59 
 
 		 755 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  24.59 
 
 		 755 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.9 
 
 		 863 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  25.22 
 
 		 631 aa  53.5  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.13 
 
 		 892 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  23.45 
 
 		 765 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  32.49 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  31.25 
 
 		 618 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.83 
 
 		 867 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  24.48 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.11 
 
 		 1679 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.65 
 
 		 1266 aa  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  29.55 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1059 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  27.03 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1389 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.23 
 
 		 1107 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  30.08 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89214  predicted protein  24.44 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  26.16 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.66 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  24.54 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  25.37 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  28.47 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  22.99 
 
 		 757 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  31.21 
 
 		 993 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  28.89 
 
 		 273 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.88 
 
 		 772 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  30 
 
 		 994 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  27.4 
 
 		 972 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  27 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  27.95 
 
 		 937 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>