32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1488 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  977    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  47.07 
 
 		 586 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  42.76 
 
 		 581 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  51.38 
 
 		 479 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  30.35 
 
 		 277 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  32.22 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  32.12 
 
 		 816 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.35 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  28.57 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1389 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.8 
 
 		 1679 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05536  hypothetical protein  35.58 
 
 		 110 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  32.05 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  29.03 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.76 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1059 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  27.04 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 		 450 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  39.76 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  32.48 
 
 		 318 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  32.2 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  28.7 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  28.71 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.52 
 
 		 863 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  31.58 
 
 		 301 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.81 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  30.84 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  30.51 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.03 
 
 		 937 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 937 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>