109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3882 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 816 aa  1572    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1389 aa  148  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  27.31 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  27.69 
 
 		 618 aa  129  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.6 
 
 		 1679 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  38.7 
 
 		 452 aa  125  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  28.43 
 
 		 450 aa  124  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  32.73 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  30.54 
 
 		 401 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  37.95 
 
 		 586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  30.93 
 
 		 277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  35.71 
 
 		 484 aa  112  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  37.56 
 
 		 581 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  29.68 
 
 		 424 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  22.5 
 
 		 384 aa  83.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  29.82 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  30.61 
 
 		 901 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.93 
 
 		 1266 aa  77  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  32.61 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  32.12 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  39.37 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  37.07 
 
 		 1041 aa  74.3  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.03 
 
 		 482 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  27.83 
 
 		 318 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1059 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  28.16 
 
 		 902 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1191 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.48 
 
 		 1107 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  37.98 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.08 
 
 		 848 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  32.41 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  34.31 
 
 		 1107 aa  64.3  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  36.67 
 
 		 732 aa  63.9  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  39.13 
 
 		 1393 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  39.13 
 
 		 1393 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  31.58 
 
 		 419 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  31.03 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  34.38 
 
 		 848 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  35.16 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.79 
 
 		 863 aa  60.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  41.57 
 
 		 3278 aa  59.7  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  33.33 
 
 		 855 aa  59.3  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.44 
 
 		 531 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.46 
 
 		 1212 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  27.84 
 
 		 643 aa  55.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  26.88 
 
 		 439 aa  55.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  27.44 
 
 		 416 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34 
 
 		 972 aa  55.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.74 
 
 		 1344 aa  54.7  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  28.09 
 
 		 443 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  36.47 
 
 		 347 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  28.74 
 
 		 755 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  34.15 
 
 		 950 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  34.92 
 
 		 611 aa  54.3  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  32.11 
 
 		 443 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 483 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.1 
 
 		 449 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  28.09 
 
 		 318 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.93 
 
 		 892 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  28.77 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  28.09 
 
 		 318 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.91 
 
 		 868 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  20.53 
 
 		 350 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.26 
 
 		 913 aa  52  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  32.22 
 
 		 994 aa  52  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  28.87 
 
 		 191 aa  51.6  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  28.86 
 
 		 826 aa  51.6  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  36.59 
 
 		 571 aa  51.2  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.45 
 
 		 354 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.75 
 
 		 508 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  32.63 
 
 		 820 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  29.09 
 
 		 868 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1011 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  36.59 
 
 		 1098 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  34.33 
 
 		 355 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  32.14 
 
 		 542 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  35.9 
 
 		 991 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  26.97 
 
 		 755 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  26.97 
 
 		 731 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  26.97 
 
 		 755 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  32.14 
 
 		 765 aa  48.5  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.09 
 
 		 868 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  31.93 
 
 		 1311 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  32.14 
 
 		 779 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.63 
 
 		 772 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  29.67 
 
 		 1258 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  42.31 
 
 		 1750 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  31.01 
 
 		 987 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.79 
 
 		 911 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  28.42 
 
 		 765 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  30.43 
 
 		 989 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  26.04 
 
 		 431 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  27.54 
 
 		 765 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.11 
 
 		 1263 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  31.12 
 
 		 766 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  30.61 
 
 		 755 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0044  hypothetical protein  34.18 
 
 		 568 aa  45.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.36 
 
 		 416 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>