32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0899 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  40.66 
 
 		 906 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  64.38 
 
 		 991 aa  1378    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  100 
 
 		 987 aa  2062    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  62.18 
 
 		 989 aa  1303    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  26.73 
 
 		 908 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  26.11 
 
 		 923 aa  278  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1073 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  25 
 
 		 1071 aa  208  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1075 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1073 aa  204  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1077 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1073 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1073 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1077 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1074 aa  161  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  26.17 
 
 		 848 aa  51.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.41 
 
 		 868 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  29.41 
 
 		 867 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 868 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1787  hypothetical protein  33.98 
 
 		 651 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.036788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1780  hypothetical protein  33.98 
 
 		 651 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1503 aa  48.1  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1518 aa  48.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2498  hypothetical protein  33.98 
 
 		 651 aa  48.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.305411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  31.01 
 
 		 816 aa  47  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 868 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1824  hypothetical protein  33.98 
 
 		 651 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000670004  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  29.41 
 
 		 868 aa  47  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.45 
 
 		 868 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  27.45 
 
 		 868 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  34.33 
 
 		 902 aa  45.8  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  34.33 
 
 		 901 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>