17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0443 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  100 
 
 
1073 aa  2228    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  96.46 
 
 
1073 aa  2133    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  87.33 
 
 
1073 aa  1927    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  95.62 
 
 
1073 aa  2121    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  80.04 
 
 
1077 aa  1785    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  68.89 
 
 
1074 aa  1483    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  80.52 
 
 
1071 aa  1784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  80.41 
 
 
1077 aa  1793    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  80.91 
 
 
1075 aa  1794    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  25.42 
 
 
906 aa  261  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  28.14 
 
 
908 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  28.74 
 
 
923 aa  244  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  25.34 
 
 
991 aa  224  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  25.34 
 
 
989 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  24.84 
 
 
987 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0390  hypothetical protein  67.16 
 
 
79 aa  99  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  34.4 
 
 
425 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>