30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0921 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  43.31 
 
 		 906 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  62.87 
 
 		 991 aa  1334    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  62.18 
 
 		 987 aa  1303    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  100 
 
 		 989 aa  2050    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  26.47 
 
 		 908 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  26.64 
 
 		 923 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1073 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1073 aa  218  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1073 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1071 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1073 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1075 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1077 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1077 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1074 aa  193  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  34.65 
 
 		 855 aa  57.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.07 
 
 		 848 aa  57.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  34 
 
 		 1107 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.07 
 
 		 848 aa  54.3  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  36.7 
 
 		 868 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  35.58 
 
 		 868 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  33.86 
 
 		 645 aa  52.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  33.65 
 
 		 868 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 868 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 868 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.07 
 
 		 867 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.07 
 
 		 868 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1011 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  30.43 
 
 		 816 aa  46.2  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32.32 
 
 		 869 aa  44.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>