29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1054 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  64.38 
 
 		 987 aa  1378    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  100 
 
 		 991 aa  2067    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  62.87 
 
 		 989 aa  1334    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  42.48 
 
 		 906 aa  625  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  25.54 
 
 		 908 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  25.34 
 
 		 923 aa  257  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1073 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1073 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1073 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1073 aa  210  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1075 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1077 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1071 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1077 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1074 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.79 
 
 		 868 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.65 
 
 		 868 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.61 
 
 		 868 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  27.78 
 
 		 848 aa  50.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 868 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.68 
 
 		 868 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  27.61 
 
 		 645 aa  48.9  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 868 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  35.9 
 
 		 816 aa  48.9  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.68 
 
 		 867 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.46 
 
 		 855 aa  47.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1518 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1503 aa  45.8  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.57 
 
 		 848 aa  45.8  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>