15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003968 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  43.31 
 
 		 989 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  40.66 
 
 		 987 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1901    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  42.48 
 
 		 991 aa  625  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1073 aa  258  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1075 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1073 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1073 aa  254  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1077 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1071 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1077 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1073 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  25.9 
 
 		 908 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1074 aa  234  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  26.12 
 
 		 923 aa  233  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>