16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0675 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  91.41 
 
 
923 aa  1707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  100 
 
 
908 aa  1852    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  26.73 
 
 
987 aa  281  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  26.47 
 
 
989 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  25.54 
 
 
991 aa  263  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  28.52 
 
 
1073 aa  250  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  27.3 
 
 
1073 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  28.03 
 
 
1074 aa  243  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  27.87 
 
 
1073 aa  243  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  28.65 
 
 
1071 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  27.7 
 
 
1073 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  25.9 
 
 
906 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  28.3 
 
 
1077 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  28.49 
 
 
1077 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  28.29 
 
 
1075 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  20.32 
 
 
770 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>