17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3842 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  80.04 
 
 
1073 aa  1798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  80.32 
 
 
1073 aa  1818    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  82.08 
 
 
1073 aa  1818    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  79.94 
 
 
1073 aa  1819    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  100 
 
 
1077 aa  2235    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  68.05 
 
 
1074 aa  1459    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  96.1 
 
 
1071 aa  2070    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  96.84 
 
 
1077 aa  2094    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  95.25 
 
 
1075 aa  2056    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  26.51 
 
 
906 aa  263  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  26.97 
 
 
908 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  28.27 
 
 
923 aa  234  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  24.82 
 
 
989 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  24.58 
 
 
987 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  25.49 
 
 
991 aa  207  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0390  hypothetical protein  67.16 
 
 
79 aa  100  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  36.11 
 
 
425 aa  65.5  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>