17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0393 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  67.86 
 
 		 1073 aa  1497    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  67.73 
 
 		 1073 aa  1519    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  67.98 
 
 		 1073 aa  1521    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  66.76 
 
 		 1073 aa  1472    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  100 
 
 		 1074 aa  2218    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  67.36 
 
 		 1071 aa  1472    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  66.92 
 
 		 1077 aa  1466    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  67.29 
 
 		 1077 aa  1483    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  67.67 
 
 		 1075 aa  1483    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07430  hypothetical protein  27.66 
 
 		 923 aa  253  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0675  hypothetical protein  28.16 
 
 		 908 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003968  hypothetical protein  25.42 
 
 		 906 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0731813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  26.13 
 
 		 989 aa  204  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  25.23 
 
 		 991 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  24.66 
 
 		 987 aa  177  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0390  hypothetical protein  95.59 
 
 		 79 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  34.78 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>