22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3268 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  863    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1024 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1314 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  32.81 
 
 		 1189 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  32.73 
 
 		 646 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0439  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1073 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0393  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1074 aa  63.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.71 
 
 		 1482 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0440  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1073 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0418  hypothetical protein  37.96 
 
 		 1071 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3586  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1073 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3842  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1077 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0443  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1073 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3916  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1075 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4038  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1077 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  25.45 
 
 		 2004 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  32.71 
 
 		 873 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1017 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  40.74 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 2082 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  28.23 
 
 		 1814 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  39.44 
 
 		 679 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>