196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2564 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 1107 aa  2182    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  53.38 
 
 		 1408 aa  352  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  52.58 
 
 		 1422 aa  324  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  51.29 
 
 		 1410 aa  301  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  51.29 
 
 		 1410 aa  301  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  48.17 
 
 		 1108 aa  258  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 524 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  32.94 
 
 		 576 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  32.65 
 
 		 533 aa  179  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  32.55 
 
 		 576 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.68 
 
 		 1217 aa  175  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  32.52 
 
 		 526 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  32.94 
 
 		 576 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  36.34 
 
 		 1750 aa  158  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  31.54 
 
 		 501 aa  151  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  35.34 
 
 		 1771 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  39.15 
 
 		 833 aa  141  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  28.88 
 
 		 1222 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.28 
 
 		 1212 aa  135  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  34.29 
 
 		 478 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  37.08 
 
 		 480 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  32.91 
 
 		 826 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  33.87 
 
 		 478 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  34.29 
 
 		 478 aa  129  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  38.43 
 
 		 480 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.41 
 
 		 921 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  36.59 
 
 		 480 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  35.37 
 
 		 480 aa  125  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  37.17 
 
 		 480 aa  124  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  31.18 
 
 		 480 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  32.33 
 
 		 1011 aa  121  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  33.9 
 
 		 571 aa  116  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  36.84 
 
 		 1152 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  29.47 
 
 		 591 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  34.65 
 
 		 855 aa  99.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  30.38 
 
 		 624 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  36.6 
 
 		 656 aa  99  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  40.82 
 
 		 1393 aa  98.6  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.82 
 
 		 848 aa  98.6  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  31.7 
 
 		 772 aa  98.2  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  41.24 
 
 		 1393 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  32.78 
 
 		 3278 aa  97.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  36.68 
 
 		 868 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  36.79 
 
 		 867 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  36.68 
 
 		 868 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  28.79 
 
 		 743 aa  95.5  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  36.18 
 
 		 868 aa  95.1  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  33.08 
 
 		 848 aa  94  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  24.51 
 
 		 628 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  37.57 
 
 		 902 aa  93.2  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  36.65 
 
 		 901 aa  92.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.83 
 
 		 869 aa  89.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  26.01 
 
 		 618 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  30.63 
 
 		 1376 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  33.67 
 
 		 868 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.65 
 
 		 868 aa  87  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  32.48 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  30.42 
 
 		 635 aa  85.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  29.31 
 
 		 296 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  32.51 
 
 		 868 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  27.45 
 
 		 743 aa  83.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  30.19 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  27.09 
 
 		 1129 aa  80.9  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  28.85 
 
 		 635 aa  79.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  33.15 
 
 		 820 aa  79  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  32.37 
 
 		 1084 aa  77.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  31.52 
 
 		 972 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 		 863 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  31.89 
 
 		 956 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.31 
 
 		 1565 aa  76.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  34.75 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  43.16 
 
 		 1011 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.11 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.11 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  36.03 
 
 		 746 aa  72.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.46 
 
 		 11716 aa  72  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  31.58 
 
 		 783 aa  72  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  30.26 
 
 		 634 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.43 
 
 		 911 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.13 
 
 		 913 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  38.66 
 
 		 826 aa  69.3  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  27.81 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  27.53 
 
 		 985 aa  67.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  31.01 
 
 		 325 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.21 
 
 		 3197 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  39.17 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  34.31 
 
 		 816 aa  64.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1022 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.48 
 
 		 807 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.54 
 
 		 1426 aa  63.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  34.78 
 
 		 1178 aa  63.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  40.7 
 
 		 809 aa  63.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  34.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  23.02 
 
 		 8871 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.09 
 
 		 1146 aa  62.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1406 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  31.51 
 
 		 604 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.54 
 
 		 3793 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>