24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1555 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  100 
 
 		 628 aa  1280    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  43.69 
 
 		 618 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  31.19 
 
 		 826 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  24.51 
 
 		 1107 aa  86.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  28.34 
 
 		 1422 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  26.65 
 
 		 1408 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  25 
 
 		 1108 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  25.5 
 
 		 1410 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  25.5 
 
 		 1410 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  25.1 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  23.77 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  26.32 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  42.47 
 
 		 861 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  30.34 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  23.58 
 
 		 533 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1820  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 699 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0873981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  24.91 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  38.82 
 
 		 570 aa  47.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  29.05 
 
 		 480 aa  47.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  24.81 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  27.75 
 
 		 480 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  24.16 
 
 		 478 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  26.52 
 
 		 480 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  27.37 
 
 		 524 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>