39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0649 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  95.82 
 
 		 478 aa  929    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  72.8 
 
 		 480 aa  752    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  72.18 
 
 		 480 aa  745    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  71.34 
 
 		 480 aa  739    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  83.19 
 
 		 480 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  72.8 
 
 		 480 aa  748    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  68.83 
 
 		 480 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  986    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  97.28 
 
 		 478 aa  943    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  36.17 
 
 		 1410 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  36.17 
 
 		 1410 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  35.27 
 
 		 1107 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 1408 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  29.4 
 
 		 576 aa  123  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  27.64 
 
 		 576 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  27.49 
 
 		 524 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  27.34 
 
 		 533 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  28.4 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  27.44 
 
 		 576 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  29.19 
 
 		 1422 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1108 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.41 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.51 
 
 		 826 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  28.83 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.32 
 
 		 921 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  24.29 
 
 		 1222 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  27.75 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  27.05 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  27.05 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  26.63 
 
 		 1178 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  29.73 
 
 		 743 aa  54.7  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  24.76 
 
 		 1129 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  25.65 
 
 		 593 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 		 778 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  22.93 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  24.81 
 
 		 628 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.52 
 
 		 818 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.94 
 
 		 706 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  26.63 
 
 		 547 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>