38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3578 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  95.62 
 
 		 480 aa  955    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  73.85 
 
 		 478 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  998    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  73.11 
 
 		 480 aa  732    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  72.8 
 
 		 478 aa  737    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  73.22 
 
 		 478 aa  740    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  97.08 
 
 		 480 aa  968    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  78.96 
 
 		 480 aa  810    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  95.83 
 
 		 480 aa  958    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  37.18 
 
 		 1410 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  37.18 
 
 		 1410 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  34.87 
 
 		 1408 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  38.2 
 
 		 1107 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  28.61 
 
 		 576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  29.18 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  28.61 
 
 		 533 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  27.82 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  29.11 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  26.96 
 
 		 576 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1108 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 1422 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.79 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.35 
 
 		 921 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.87 
 
 		 826 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  25.83 
 
 		 1222 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  26.15 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  27.16 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  25.91 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  25.91 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.27 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  25.63 
 
 		 1178 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  25.69 
 
 		 743 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  25.51 
 
 		 1129 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.02 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  27.75 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  24.33 
 
 		 717 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  27.38 
 
 		 593 aa  43.9  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26.29 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>