43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3072 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  85.36 
 
 		 524 aa  914    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  76.92 
 
 		 533 aa  822    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1080    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  73.11 
 
 		 576 aa  772    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  72.35 
 
 		 576 aa  762    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  71.51 
 
 		 576 aa  760    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  34.52 
 
 		 1408 aa  176  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.58 
 
 		 1107 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 1410 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 1410 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1108 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  34.12 
 
 		 1422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  28.12 
 
 		 480 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  27.59 
 
 		 480 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  28.4 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  29.18 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 478 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  28.68 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  28.65 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  26.93 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  26.93 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  27.12 
 
 		 826 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  26.36 
 
 		 501 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.7 
 
 		 1222 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.29 
 
 		 921 aa  77  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  31.66 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  24.25 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  24.25 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  23.56 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  29.13 
 
 		 307 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  23.71 
 
 		 1129 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  24.69 
 
 		 807 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  21.75 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  24.47 
 
 		 717 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.69 
 
 		 835 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.81 
 
 		 1679 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  23 
 
 		 778 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.68 
 
 		 818 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.05 
 
 		 728 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  23.03 
 
 		 776 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  32.11 
 
 		 1178 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  22.83 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  22.82 
 
 		 628 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>