147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3493 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  100 
 
 		 921 aa  1851    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  39.54 
 
 		 1222 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 		 624 aa  221  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  32.44 
 
 		 743 aa  214  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.95 
 
 		 821 aa  183  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.57 
 
 		 818 aa  170  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  27.54 
 
 		 717 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  28.11 
 
 		 776 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  30 
 
 		 784 aa  144  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.45 
 
 		 714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  38.57 
 
 		 307 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.53 
 
 		 837 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  29.96 
 
 		 778 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 2082 aa  134  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  28.02 
 
 		 792 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  25.36 
 
 		 911 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.24 
 
 		 900 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3491  hypothetical protein  51.79 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.09 
 
 		 1919 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  34.07 
 
 		 1178 aa  124  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  33.77 
 
 		 297 aa  124  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  30.46 
 
 		 363 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  30.46 
 
 		 363 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  38.05 
 
 		 295 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  37.61 
 
 		 298 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  29.41 
 
 		 1107 aa  120  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  32.59 
 
 		 593 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  38.53 
 
 		 295 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  38.16 
 
 		 260 aa  114  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  30.14 
 
 		 726 aa  114  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.22 
 
 		 561 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.59 
 
 		 1848 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.15 
 
 		 469 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.1 
 
 		 554 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  30.31 
 
 		 566 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  30.84 
 
 		 577 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.71 
 
 		 2816 aa  104  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.1 
 
 		 555 aa  104  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  29.89 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  30.34 
 
 		 579 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  30.83 
 
 		 461 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.14 
 
 		 556 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.26 
 
 		 567 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  28.79 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.83 
 
 		 555 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  37.75 
 
 		 285 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16110  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  100  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.81 
 
 		 553 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  27.31 
 
 		 1129 aa  99  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  22.63 
 
 		 807 aa  98.6  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.74 
 
 		 706 aa  98.2  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.59 
 
 		 1679 aa  97.8  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 1408 aa  97.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  28.72 
 
 		 477 aa  97.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.77 
 
 		 570 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  26.63 
 
 		 461 aa  94.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  32.18 
 
 		 551 aa  94.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.46 
 
 		 443 aa  94.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  29.98 
 
 		 1410 aa  94.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  29.98 
 
 		 1410 aa  94.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1108 aa  94.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  31.56 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.89 
 
 		 835 aa  93.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  32.18 
 
 		 681 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  27.4 
 
 		 576 aa  91.3  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  26.8 
 
 		 576 aa  91.3  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  28.88 
 
 		 558 aa  91.3  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  26.59 
 
 		 576 aa  89.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3496  hypothetical protein  31.82 
 
 		 557 aa  88.6  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  31.98 
 
 		 826 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.36 
 
 		 417 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  30.35 
 
 		 480 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  31.86 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  33.91 
 
 		 546 aa  87  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  30.13 
 
 		 480 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  31.96 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  29.37 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  25.69 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  40.68 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.11 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  27.25 
 
 		 1422 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  30.22 
 
 		 480 aa  84  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  29.28 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  32.32 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  25.83 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  34.63 
 
 		 14609 aa  77.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  31.19 
 
 		 478 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  25.29 
 
 		 526 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.36 
 
 		 547 aa  77  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  28.6 
 
 		 524 aa  77  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  29.28 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  27.52 
 
 		 554 aa  77  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  27.23 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.15 
 
 		 692 aa  74.3  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.26 
 
 		 643 aa  73.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  25.3 
 
 		 1187 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  24.6 
 
 		 1207 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  28.63 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  34.04 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>