48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0813 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  72.48 
 
 		 480 aa  745    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  73.53 
 
 		 480 aa  752    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  70.8 
 
 		 480 aa  725    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  73.11 
 
 		 480 aa  750    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  73.11 
 
 		 480 aa  751    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  83.19 
 
 		 478 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  83.19 
 
 		 478 aa  804    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  83.62 
 
 		 478 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 1408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  28.12 
 
 		 526 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  38.2 
 
 		 1107 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  29.91 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  31.27 
 
 		 1410 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  31.27 
 
 		 1410 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  28.95 
 
 		 576 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  28.16 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  27.53 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  27.79 
 
 		 576 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 1422 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1108 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  26.67 
 
 		 501 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  26.69 
 
 		 826 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  27.96 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.28 
 
 		 921 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  30.49 
 
 		 1222 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  31.03 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  26.83 
 
 		 743 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  25.62 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  25.62 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  23.68 
 
 		 499 aa  53.5  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  25.51 
 
 		 1129 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  25.63 
 
 		 1178 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.17 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  26.24 
 
 		 546 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.07 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  29.22 
 
 		 628 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.75 
 
 		 555 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 658 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  25.59 
 
 		 778 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  25.54 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  27.22 
 
 		 807 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  25.13 
 
 		 533 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.34 
 
 		 567 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.81 
 
 		 554 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.68 
 
 		 706 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.73 
 
 		 553 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>