46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1207 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  81.61 
 
 		 524 aa  882    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  85.74 
 
 		 576 aa  932    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  85.55 
 
 		 576 aa  937    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  76.92 
 
 		 526 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  85.93 
 
 		 576 aa  929    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1098    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  32.66 
 
 		 1408 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  31.88 
 
 		 1107 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 1410 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 1410 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.27 
 
 		 1108 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  30.47 
 
 		 1422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  29.67 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  28.61 
 
 		 480 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  29.81 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  28 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.33 
 
 		 826 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  30.03 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  30.56 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  28.57 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  28.51 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.78 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.54 
 
 		 921 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  25.05 
 
 		 1222 aa  84  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  30.38 
 
 		 624 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  33.03 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  24.95 
 
 		 743 aa  67  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  28.33 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  26.71 
 
 		 443 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  24.44 
 
 		 628 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  24.26 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  23.51 
 
 		 363 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.91 
 
 		 807 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.79 
 
 		 1679 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.39 
 
 		 835 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  26.86 
 
 		 1178 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  23.69 
 
 		 1129 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  27.46 
 
 		 558 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  27.83 
 
 		 714 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  27.18 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  25.62 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  25.69 
 
 		 328 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 		 658 aa  43.9  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  22.93 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.95 
 
 		 1919 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>