34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1401 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1076    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  81.61 
 
 		 533 aa  882    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  85.36 
 
 		 526 aa  914    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  77.57 
 
 		 576 aa  829    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  76.43 
 
 		 576 aa  821    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  76.81 
 
 		 576 aa  817    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  33.09 
 
 		 1107 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  32.23 
 
 		 1408 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  32.88 
 
 		 1410 aa  156  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  32.88 
 
 		 1410 aa  156  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1108 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  32.48 
 
 		 1422 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  30.06 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  27.16 
 
 		 480 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  27.49 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  28.78 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  27.84 
 
 		 480 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  27.74 
 
 		 478 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  29.43 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  29.11 
 
 		 480 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  28.8 
 
 		 480 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.62 
 
 		 826 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  27.14 
 
 		 501 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  25.88 
 
 		 1222 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.6 
 
 		 921 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  32.81 
 
 		 624 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  23.01 
 
 		 743 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  23.79 
 
 		 1129 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  24 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  24 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  27.49 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  27.37 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  22.46 
 
 		 728 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  31.22 
 
 		 593 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>