158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0670 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  82.55 
 
 
784 aa  1146    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  83.8 
 
 
776 aa  1135    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
778 aa  1495    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  64.52 
 
 
837 aa  762    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  79.04 
 
 
792 aa  1066    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.68 
 
 
821 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  39.42 
 
 
1187 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  38.1 
 
 
743 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  40.27 
 
 
1207 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.98 
 
 
818 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  38.66 
 
 
717 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.38 
 
 
2082 aa  356  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  38.94 
 
 
714 aa  351  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  63.59 
 
 
553 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  56.04 
 
 
389 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  36.35 
 
 
911 aa  333  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  55.86 
 
 
554 aa  312  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.52 
 
 
556 aa  300  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  54.35 
 
 
561 aa  297  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  53.85 
 
 
477 aa  296  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  53.46 
 
 
569 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  53.11 
 
 
560 aa  292  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  48.43 
 
 
579 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  54.1 
 
 
555 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  55.14 
 
 
546 aa  284  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.94 
 
 
570 aa  283  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  51.33 
 
 
558 aa  277  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  50.39 
 
 
551 aa  277  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  47.8 
 
 
593 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  52.03 
 
 
567 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  51.62 
 
 
553 aa  276  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  51.47 
 
 
563 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.67 
 
 
555 aa  272  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  47.78 
 
 
554 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  50.88 
 
 
376 aa  251  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.05 
 
 
417 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  40.39 
 
 
1129 aa  238  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  47.4 
 
 
558 aa  238  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  43.8 
 
 
941 aa  237  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  47.04 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  44.25 
 
 
835 aa  233  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  34.71 
 
 
1222 aa  231  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.15 
 
 
787 aa  224  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  51.52 
 
 
566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  38.2 
 
 
461 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.72 
 
 
1679 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.62 
 
 
469 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.52 
 
 
1919 aa  217  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  38 
 
 
461 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  41.48 
 
 
817 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  42.78 
 
 
1848 aa  214  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  44.75 
 
 
681 aa  211  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  37.39 
 
 
363 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  37.39 
 
 
363 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  39.85 
 
 
443 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  41.14 
 
 
403 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.47 
 
 
810 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  40.83 
 
 
449 aa  208  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.83 
 
 
1147 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.32 
 
 
1126 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  40.98 
 
 
544 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 
745 aa  196  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.59 
 
 
706 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  37.6 
 
 
618 aa  194  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  33.04 
 
 
575 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  39.69 
 
 
638 aa  191  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  39.45 
 
 
602 aa  191  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  35.83 
 
 
447 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  27.23 
 
 
807 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.32 
 
 
535 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.6 
 
 
726 aa  184  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.91 
 
 
728 aa  177  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  39.32 
 
 
737 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  36.1 
 
 
396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  34.73 
 
 
454 aa  174  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  34.22 
 
 
341 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  36.76 
 
 
900 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  33.42 
 
 
547 aa  146  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.92 
 
 
454 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.96 
 
 
921 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  33.58 
 
 
450 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  31.96 
 
 
597 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  32.48 
 
 
418 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.45 
 
 
692 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  31.3 
 
 
533 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  32.51 
 
 
547 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  33.84 
 
 
328 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  32.34 
 
 
14609 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.76 
 
 
375 aa  119  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  30.38 
 
 
390 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.09 
 
 
326 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  32.82 
 
 
624 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  28.99 
 
 
499 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  52.9 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  27.13 
 
 
558 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.46 
 
 
2816 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  38.57 
 
 
375 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  31.58 
 
 
643 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.76 
 
 
727 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36476  predicted protein  25.97 
 
 
520 aa  97.8  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>