106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4142 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
575 aa  1149    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  33.05 
 
 
778 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
837 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  33.77 
 
 
792 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  34.2 
 
 
784 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  33.57 
 
 
776 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  33.05 
 
 
449 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.87 
 
 
821 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  31.5 
 
 
1129 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  28.67 
 
 
911 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.21 
 
 
553 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.79 
 
 
1919 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  29.43 
 
 
461 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.83 
 
 
818 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.9 
 
 
461 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.98 
 
 
2082 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  31.43 
 
 
396 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  25.96 
 
 
743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.78 
 
 
638 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  34.58 
 
 
376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
745 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.34 
 
 
554 aa  126  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  31.91 
 
 
835 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  33.24 
 
 
389 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  36.02 
 
 
553 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.12 
 
 
810 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.39 
 
 
787 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  30.28 
 
 
558 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  28.47 
 
 
714 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.42 
 
 
737 aa  114  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  27.97 
 
 
1187 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  26.25 
 
 
807 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.15 
 
 
1679 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  33.14 
 
 
579 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.29 
 
 
941 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  31.59 
 
 
900 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.21 
 
 
469 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  26.81 
 
 
1207 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.75 
 
 
556 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  30.3 
 
 
547 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  27.25 
 
 
717 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.61 
 
 
817 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  30.63 
 
 
577 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  30.59 
 
 
477 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  29.09 
 
 
551 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  31.56 
 
 
558 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  27.98 
 
 
602 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  30.42 
 
 
566 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  29.7 
 
 
544 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.27 
 
 
417 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.61 
 
 
561 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.89 
 
 
706 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  27.02 
 
 
593 aa  99.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  30.45 
 
 
560 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  29.76 
 
 
554 aa  96.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.04 
 
 
567 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.55 
 
 
570 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  28.25 
 
 
618 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.2 
 
 
555 aa  93.6  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.67 
 
 
1848 aa  93.6  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.3 
 
 
546 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  27.85 
 
 
403 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  24.1 
 
 
363 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  24.1 
 
 
363 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.16 
 
 
563 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  30.57 
 
 
569 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  27.56 
 
 
443 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
447 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  31.17 
 
 
681 aa  87  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.28 
 
 
1147 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  26.87 
 
 
454 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  29.59 
 
 
1222 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.72 
 
 
535 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.81 
 
 
555 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.41 
 
 
692 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.04 
 
 
728 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  24.53 
 
 
643 aa  70.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  23.68 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.16 
 
 
643 aa  67.4  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.19 
 
 
326 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  31.64 
 
 
332 aa  63.9  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  26.32 
 
 
14609 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.96 
 
 
1126 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  34.12 
 
 
106 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  23.85 
 
 
547 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  30.16 
 
 
375 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  28.75 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.23 
 
 
454 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.84 
 
 
209 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  28.12 
 
 
375 aa  56.6  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  24.66 
 
 
624 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  24 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  31.41 
 
 
2367 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  24.15 
 
 
418 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  24.83 
 
 
450 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  23.57 
 
 
328 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  25.07 
 
 
597 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  27.75 
 
 
471 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  21.72 
 
 
341 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  21.85 
 
 
657 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>