120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0168 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  65.18 
 
 
787 aa  997    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  48.54 
 
 
1187 aa  705    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  100 
 
 
817 aa  1660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  49.24 
 
 
1207 aa  710    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.62 
 
 
941 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  39.29 
 
 
535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.96 
 
 
1147 aa  240  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  40.93 
 
 
544 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  38.13 
 
 
454 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40.39 
 
 
784 aa  227  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  39.85 
 
 
792 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  41.48 
 
 
778 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  40.91 
 
 
602 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  39.7 
 
 
776 aa  207  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.78 
 
 
837 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  37.92 
 
 
447 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.82 
 
 
553 aa  181  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  36.57 
 
 
389 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  41.97 
 
 
326 aa  154  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  32.34 
 
 
449 aa  144  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.27 
 
 
818 aa  144  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  29.44 
 
 
579 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.46 
 
 
821 aa  141  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.8 
 
 
556 aa  140  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  30.81 
 
 
477 aa  140  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.01 
 
 
570 aa  138  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  31.59 
 
 
569 aa  135  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.92 
 
 
593 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.13 
 
 
554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  34.92 
 
 
618 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.14 
 
 
563 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.45 
 
 
567 aa  129  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  31.06 
 
 
553 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  33.65 
 
 
376 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.18 
 
 
810 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  30.69 
 
 
551 aa  128  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.32 
 
 
561 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.04 
 
 
546 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.94 
 
 
1848 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.16 
 
 
417 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  32.98 
 
 
681 aa  125  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.19 
 
 
555 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  31.17 
 
 
560 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  27.6 
 
 
461 aa  121  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.55 
 
 
555 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  30.69 
 
 
558 aa  120  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  30.1 
 
 
341 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  31.91 
 
 
558 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  31.2 
 
 
835 aa  118  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  26.44 
 
 
807 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  30.03 
 
 
554 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.79 
 
 
1919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  32.13 
 
 
566 aa  114  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  29.36 
 
 
911 aa  114  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.19 
 
 
717 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30.61 
 
 
743 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  33.95 
 
 
577 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.54 
 
 
1679 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.03 
 
 
2082 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.26 
 
 
900 aa  108  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  29.69 
 
 
403 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 
547 aa  104  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  26.11 
 
 
714 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.83 
 
 
443 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.57 
 
 
469 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.61 
 
 
575 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.73 
 
 
726 aa  98.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
745 aa  97.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  30.21 
 
 
638 aa  95.5  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.35 
 
 
737 aa  95.5  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  25.37 
 
 
396 aa  94.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  27.7 
 
 
1129 aa  93.6  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  30.63 
 
 
461 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  41.46 
 
 
133 aa  91.3  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31 
 
 
706 aa  90.9  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  26.63 
 
 
14609 aa  87.8  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.06 
 
 
1222 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.88 
 
 
692 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  29.4 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.3 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.62 
 
 
728 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.18 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  30.14 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.98 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  24.75 
 
 
643 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.67 
 
 
558 aa  78.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  27.99 
 
 
328 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.77 
 
 
363 aa  76.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.77 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  26.65 
 
 
727 aa  75.1  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  32.35 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  28.01 
 
 
547 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  29.79 
 
 
390 aa  72  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26074  predicted protein  25.28 
 
 
783 aa  71.6  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  26.16 
 
 
1312 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  23.81 
 
 
624 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  26.33 
 
 
399 aa  65.1  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  26.43 
 
 
533 aa  64.3  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  23.28 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.29 
 
 
209 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>