More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4027 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  100 
 
 
638 aa  1271    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
745 aa  239  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.37 
 
 
837 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  42.9 
 
 
792 aa  209  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  38.52 
 
 
389 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.4 
 
 
553 aa  197  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  46.05 
 
 
376 aa  193  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.69 
 
 
778 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  43.23 
 
 
776 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  41.83 
 
 
784 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  39.24 
 
 
835 aa  173  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  37.65 
 
 
551 aa  157  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  32.88 
 
 
1129 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.53 
 
 
821 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  35.96 
 
 
477 aa  137  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  36.08 
 
 
579 aa  137  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.98 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  32.43 
 
 
363 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  32.13 
 
 
363 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  35.05 
 
 
449 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  35.69 
 
 
546 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.52 
 
 
818 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.69 
 
 
554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  36.71 
 
 
560 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  34.31 
 
 
681 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  30.37 
 
 
575 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.49 
 
 
553 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  29.49 
 
 
743 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.87 
 
 
556 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  36.44 
 
 
569 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.11 
 
 
1848 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  33.62 
 
 
558 aa  124  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.71 
 
 
737 aa  123  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.9 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.76 
 
 
555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.77 
 
 
567 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  33.56 
 
 
593 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  30.6 
 
 
911 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.8 
 
 
570 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  33.25 
 
 
554 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.3 
 
 
706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.86 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  30.54 
 
 
461 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.12 
 
 
810 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.26 
 
 
577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  34.25 
 
 
461 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  37.79 
 
 
714 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  31.34 
 
 
443 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.82 
 
 
1919 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.01 
 
 
2082 aa  107  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  34.67 
 
 
618 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.41 
 
 
417 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  33.01 
 
 
403 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.59 
 
 
1679 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.11 
 
 
1147 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  32.32 
 
 
717 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  29.79 
 
 
1187 aa  98.2  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  29.36 
 
 
807 aa  97.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.21 
 
 
817 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.27 
 
 
787 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  34.21 
 
 
566 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  28.57 
 
 
341 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  31.85 
 
 
1207 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  28.86 
 
 
558 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.22 
 
 
438 aa  90.5  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2879  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.31 
 
 
224 aa  90.5  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.14 
 
 
941 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  30.26 
 
 
544 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.77 
 
 
900 aa  87  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.66 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  28.41 
 
 
728 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  30.17 
 
 
396 aa  79  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  30.1 
 
 
726 aa  79  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  30.35 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  32.54 
 
 
375 aa  77  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.79 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.52 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.03 
 
 
692 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  29.87 
 
 
602 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  28.65 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  27.25 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  29.79 
 
 
547 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12928  transmembrane serine/threonine-protein kinase I pknI  30.8 
 
 
585 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00758832  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  34.36 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.13 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  26.33 
 
 
375 aa  72  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  32.41 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27.56 
 
 
643 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  30.32 
 
 
589 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  33.1 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  27.99 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
430 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
430 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  32.05 
 
 
332 aa  69.7  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  29.63 
 
 
576 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>